保税区储区别于一般仓储之处在于保税区储的力度要大得多。

自主管理的保税区储物流企业，必须通过海关的严格审核才能营运。

保税区储是指使用海关核准的保税区库存放保税货物的仓储行为。保税货物主要是暂时进境后还需要复运出境的货物，或者海关批准暂缓纳税的进口货物。保税区储受到海关的直接，虽然说货物也是由存货人委托保管，但保管人要对海关负责，入库或者出库单据均需要由海关签署。保税区储一般在进出境口岸附近进行。
第三方物流自主管理的保税区储业务，是近几年新推出的保税物流业务，是依据的保税货物进出口报关和完税的新型管理模式。在这种新型管理模式下，保税区可以设在保税区外，海关下放部分操作程序，由第三方物流企业自主管理，海关可以随时查看保税区的库存情况，对保税区实行。
保税区每月向海关申报一次货物进出口清单，并与海关系统核对保税货物的库存，一次完税，大大简化了进出关的手续，加快了通关速度。此种管理模式特别适用于对时间和库存要求比较高的维修备件的保税库存业务。

保税区储区别于一般仓储之处在于保税区储的力度要大得多。货物在仓库中的全周期需要能够实时掌握，因此保税区储的管理信息系统要求也高很多。库存信息化通过库存物品的入库、出库、移动和盘点等操作对企业的物流进行全面的控制和管理，能够降低库存，减少资金占用，杜绝物料积压与短缺现象，提高服务水平，保证生产经营活动的顺利进行。
自主管理的保税区储物流企业，必须通过海关的严格审核才能营运。首先，自主管理的保税区物流企业必须有很好的管理体系，还要有很好的诚信度，确保国家关税的征收，决不，保税货物的物流过程必须符合中国海关管理规范，严格执行海关进出口报关规则；其次，自主管理的保税区物流企业必须能为货主提供高质量的、符合要求的物流服务，其中包括能严格按照货主的要求进行备件的保管、存储、包装、配送、回收和退换，保证维修备件能正确、快捷、准时、保质地送达货主手中。
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