自主管理的保税区储物流企业，必须通过海关的严格审核才能营运。

保税区储受到海关的直接，虽然说货物也是由存货人委托保管，但保管人要对海关负责，入库或者出库单据均需要由海关签署。保税区储一般在进出境口岸附近进行。

货物在仓库中的全周期需要能够实时掌握，因此保税区储的管理信息系统要求也高很多。

保税区储区别于一般仓储之处在于保税区储的力度要大得多。
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