保税区储受到海关的直接，虽然说货物也是由存货人委托保管，但保管人要对海关负责，入库或者出库单据均需要由海关签署。保税区储一般在进出境口岸附近进行。

保税区每月向海关申报一次货物进出口清单，并与海关系统核对保税货物的库存，一次完税，大大简化了进出关的手续

保税区储区别于一般仓储之处在于保税区储的力度要大得多。

第三方物流自主管理的保税区储业务，是近几年新推出的保税物流业务
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